DokuWiki utilise l'UTF8 (une représentation de l'Unicode). L'encodage est envoyé dans les documents avec l'en-tête meta, et utilisé dans l'attribut accept-charset du formulaire d'édition des pages. DokuWiki ne ré-encode aucune donnée renvoyée par le navigateur, donc si celui-ci ne tient pas compte de l'attribut accept-charset, certains problèmes peuvent apparaître - cependant tous les navigateurs modernes connus comprennent parfaitement l'UTF-8.
Voyez également l'option de configuration romanization.